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目前台灣僅承認大陸最頂尖的41所大學學歷,包含九八五工程內的38所大學與北京體育大學、中央音樂學院和中央美術學院三所專業類學校。二一一工程大學是中國大陸「21世紀的100所重點大學」,目前共有112所,一旦納入台灣承認大陸校數最高將增加到153所。
馬英九表示,擴大陸生來台是他未來三年任期中非常重要的一步,近期內很快的就會與大陸達成協議,將二一一工程也納入。不過在招生方面,台灣的學校想去大陸辦博覽會,對岸的大學也想來台灣招生,前者幾乎台灣所有大學都贊成,後者卻不是所有大學都願意,擔心磁吸效應反而把好學生吸去大陸。
對此馬英九認為,要不要開放大陸學校直接來台舉辦博覽會招生,還需要一點時間達成共識,但隨著未來兩岸交流越來越頻繁,教育部多多少少必須朝這個方向逐步開放。一旦實機成熟後,兩岸招生情況就能會回歸市場機制來決定。
除了鼓勵大學招收境外學生,馬英九也提到,近年來台灣的留學生人數越來越少,30多年前台灣留學生人數一度逼近每年5萬人,現在只剩下2萬4000多人,尤其是留美學生人數銳減,很難不讓人感到憂心。他強調自己不是留學主義者,也不是說留學才會有前途,但出國留學除了增強外語能力,更重要的在於看國際間的發展成就,再回過頭檢視自己的不足。
他也提到,台灣的高等教育品質並不差,但如果與先進國家相比,還有一段不短的路要走。去年9月舉行的世界經濟論壇,台灣整體表現第13名,高等教育排第9名,顯示過去台灣高教發展「做對了幾件事」,包含邁向頂尖大學計畫、獎勵大學教學卓越計畫等,未來也應再持續加強。