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配合明年開徵證券交易所得稅，財政部昨天公告，企業的最低稅負所得稅率確定調升為12%，扣除額則自200萬元降至50萬元。國庫預計全年可增收約40億元最低稅負所得稅，中小企業影響較大。

原本企業最低稅負稅率為10%到12%，實際徵收率為10%。配合證所稅開徵，法定稅率訂為12%至15%，財政部昨天公告，明年起的實際徵收率為12%。

明年預定開徵證所稅，法人維持在最低稅負制中課稅。依修正後的所得基本稅額條例，企業的最低稅負所得稅率與扣除額均出現變動。

政府因開徵證所稅調高企業最低稅負所得稅率，一度引發台積電等高科技事業不滿，表示因此將增繳約30億元所得稅。不過，財政部強調，帳上留有大筆投資抵減稅額的高科技事業，所需增繳的未必是最低稅負所得稅，反而是稅率達到17%的一般營所稅。

財政部還指出，企業最低稅負所得稅率調升的增稅效果，未必來自高科技事業。

最低稅負制自民國95年起開徵，主要就免稅所得加徵補充性稅捐。至100年止，累計個人及企業繳出的最低稅負所得稅款約900億元，其中8成來自企業，屬於免稅證券交易繳出的補充所得稅約占55%。

企業最低稅負的扣除額（亦為申報門檻）原為200萬元，即企業應稅所得加計免稅所得後的總額超過200萬元，每年除申報一般營所稅，還要辦理最低稅負所得稅申報。

換言之，過去應稅所得加計免稅所得低於200萬元的中小企業，將受到最大衝擊，一旦應稅收入及免稅所得合計達到50萬元以上時，就必須辦理最低稅負所得稅申報。